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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR Agroécologie

AUBERT Gregoire

AUBERT Gregoire
Pôle : GEAPSI
Equipe : Génétique et génomique des Espèces Cibles Protéagineuses
Courriel : gregoire.aubert@inrae.fr
Tel : 03.80.69.31.54

Curriculum Vitae

1990 : Ingénieur Agronome ENSA Rennes (Spécialité Amélioration des Plantes)

1990-1992 : Volontaire Aide Technique CIRAD-IRFA Guadeloupe (Vieux-Habitants), Expérimentation culture du fraisier.

1993-Aujourd’hui : Ingénieur d’Etudes INRA Dijon (Station d’Amélioration des Plantes, puis UMRLEG, puis Agroécologie)

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Activités de Recherche

Génétique moléculaire des légumineuses (Pois, féverole, lentille). Acquisition et exploitation des ressources génomiques pour ces espèces.

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Mots Clés

Génétique moléculaire, Génomique, Génotypage, Légumineuses,Pois, Féverole, Résistance à la bruche.

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Pyblications

E. Carrillo-Perdomo, A. Vidal, J. Kreplak, H. Duborjal, M. Leveugle, J. Duarte, C. Desmetz, C. Deulvot, B. Raffiot, P. Marget, N. Tayeh, J. P. Pichon, M. Falque, O. C. Martin, J. Burstin & G. Aubert (2020). Development of new genetic resources for faba bean (Vicia faba L.) breeding through the discovery of gene-based SNP markers and the construction of a high-density consensus map. Scientific Reports, 10(1), 1-14.
Gallardo K., Besson A., Klein A., Le Signor C., Aubert G., Henriet C., Térézol M., Pateyron S., Sanchez M., Trouverie J., Avice J.-C., Larmure A., Salon C., Balzergue S., Burstin J. (2019). Transcriptional reprogramming of pea leaves at early reproductive stages. Front. Plant Sci. 10: 1014
Kreplak J., Madoui M.-A., Cápal P., Novák P., Labadie K., Aubert G., Bayer P.E., Gali K.K., Syme R.A., Main D., Klein A., Bérard A., Vrbová I., Fournier C., d’Agata L., Belser C., Berrabah W., Toegelová H., Milec Z., Vrána J., Lee H., Kougbeadjo A., Térézol M., Huneau C., Turo C.J., Mohellibi N., Neumann P., Falque M., Gallardo K., McGee R., Tar’an B., Bendahmane A., Aury J.-M., Batley J., Le Paslier M.-C., Ellis N., Warkentin T.D., Coyne C.J., Salse J., Edwards D., Lichtenzveig J., Macas J., Doležel J., Wincker P., Burstin J. (2019). A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution. Nature Genet. 51:1411-1422.
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Desgroux A., Baudais V.N., Aubert V., Le Roy G., de Larambergue H., Miteul H., Aubert G., Boutet G., Duc G., Baranger A., Burstin J., Manzanares-Dauleux M., Pilet-Nayel M.-L., Bourion V. (2018). Comparative genome-wide-association mapping identifies common loci controlling root system architecture and resistance to Aphanomyces euteiches in pea. Front. Plant Sci. 8: 2195.
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Desgroux A., L’Anthoëne V., Roux-Duparque M., Rivière J.-P., Aubert G., Tayeh N., Moussart A., Mangin P., Vetel P., Piriou C., McGee R., Coyne C.J., Burstin J., Baranger A., Manzanares-Dauleux M., Bourion V., Pilet-Nayel M.-L. (2016). Genome-wide association mapping of partial resistance to Aphanomyces euteiches in pea. BMC genomics. 17: 124
Alves-Carvalho S., Aubert G., Carrère S., Cruaud C., Brochot A.-L., Jacquin F., Klein A., Martin C., Boucherot K., Kreplak J., da Silva C., Moreau S., Gamas P., Wincker P., Gouzy J., Burstin J. (2015) Full-length de novo assembly of RNA-seq data in pea (Pisum sativum L.) provides a gene expression atlas and gives insights into root nodulation in this species. Plant J. 84:1-19.
Tayeh N., Aluome C., Falque M., Jacquin F., Klein A., Chauveau A., Bérard A., Houtin H., Rond C., Kreplak J., Boucherot K., Martin C., Baranger A., Pilet-Nayel M.-L., Warkentin T.D., Brunel D., Marget P., Le Paslier M.-C., Aubert G., Burstin J. The GenoPea 13.2K SNP Array enables a high density and resolution consensus genetic map. Plant J., 84: 1257-1273.
Tayeh N., Klein A., Le Paslier M.-C., Jacquin F., Houtin H., Rond C., Chabert-Martinello M., Magnin-Robert J.-B., Marget P., Aubert G., Burstin J. Genomic prediction in pea: effect of marker density and training population size and composition on prediction accuracy. Front. Plant Sci., 6:941.

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Principaux contrats

Projet Investissement d’Avenir Peamust, ANR Suscrop Profaba, CASDAR Resilens, Consortium Séquençage du génome du pois et de la féverole, IVD LAGOPEDE, PLANT2PRO FINAPEA POSITIF ARECOVER