Equipe EMFEED - Ecologie Microbienne Fonctionnelle pour la gestion des Intrants

Animation : Laurent Philippot

Les microorganismes sont des acteurs centraux dans de nombreux services essentiels délivrés par les écosystèmes terrestres, comme la filtration, le cycle des nutriments, la régulation du climat et la production alimentaire. Les pratiques agricoles peuvent avoir de forts impacts sur la diversité, l'abondance et l'activité des communautés microbiennes du sol. Cependant une compréhension globale des conséquences de ces pratiques dans un contexte de changement climatique, sur les communautés microbiennes telluriques fait toujours défaut, limitant ainsi les possibilités d’utiliser les micro-organismes dans les stratégies de gestion agricole visant à promouvoir les fonctions des écosystèmes.

L'objectif global des recherches du groupe est de mieux comprendre l'écologie et l'évolution des communautés microbiennes impliquées dans les fonctions clés supportant les services agro-écosystémiques, afin de mettre en œuvre ces connaissances dans les pratiques agro-écologiques. Ces objectifs reposent sur les trois axes prioritaires suivants:

1- Compréhension du rôle de la biodiversité des sols, des interactions abiotiques et  biotiques, y compris les interactions entre macro-organismes (plantes et faune) et micro-organismes, dans les services écosystémiques;

2- Suivi et évaluation et de l'impact des stratégies de gestion des agro-écosystèmes sur les communautés microbiennes du sol et les fonctions des sols associées, afin de promouvoir la multifonctionnalité des écosystèmes;

3- Identifier les options d'ingénierie écologique pour améliorer la durabilité des agro-écosystèmes, par exemple via la sélection artificielle de communautés microbiennes.

À cette fin, l'équipe se concentre sur (i) les services de soutien tels que le cycle de nutriments comme l'azote; (ii) les services de régulation tels que la purification des sols (biodégradation des pesticides et des antibiotiques), la régulation du climat (atténuation des émissions de gaz à effet de serre), et (iii) les services d'approvisionnement tels que la production agricole.