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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR Agroécologie

Colloque REVMICNAT : nouveaux défis posés par les microbiomes

Colloque REVMICNAT : nouveaux défis posés par les microbiomes
Dr. Manuel Blouin UMR AGROECOLOGIE: Peut-on sélectionner les microbiomes comme on sélectionne les plantes cultivées?

4eme session : Les microbes et les microbiomes : vers une nouvelle ontologie ?

« Colloque international et interdisciplinaire : nouveaux défis posés par les microbiomes»

 (International Interdisciplinary Colloquium : new challenges induced by microbiomes)

This virtual colloquium will be held on March 23rd 2021.

It is free and opened (within a limit of 70 people) upon registration to : epbapteste@gmail.com

Talk #12:15h18-15h43: Dr. Manuel Blouin (AgroSup Dijon, Département Agronomie Agroéquipements Elevage Environnement, UMR 1347 Agroécologie (INRA/ AgroSup/université de Bourgogne), Spécialité : Microbiomes et sélection artificielle

 

Titre : Peut-on sélectionner les microbiomes comme on sélectionne les plantes cultivées?

 

Résumé : L'évolution des écosystèmes est une question débattue sur un plan théorique. Mais l'absence de populations d'écosystèmes au sein desquelles il serait possible d'observer la sélection de certains variants conduit à une impasse : il n’existe pas de données empiriques pour valider ou invalider les hypothèses théoriques. Avec le développement des outils de séquençage massif, il devient possible de caractériser la structure des communautés microbiennes de nombreux microbiomes similaires (par exemple ceux des intestins humains ou des rhizosphères des plantes). On peut alors rechercher des indications d’une sélection naturelle ou mettre en place des expériences de sélection artificielle, dans lesquelles les microbiomes sont sélectionnés pour une propriété définie par l’expérimentateur. Je présenterai les résultats récents issus de la littérature sur la sélection artificielle de microbiomes, les champs d’application dans lesquels cette approche est la plus prometteuse et les obstacles à lever pour que ce champ de recherche encore embryonnaire se développe.