La 4PMI participe, par le biais de différents projets avec des partenaires académiques ou privés, à la découverte de nouveaux gènes et voies de contrôle impliquées dans la réponse des plantes aux conditions environnementales et à leur variabilité génétique, des connaissances pouvant être utilisées pour la sélection.

La 4PMI est la deuxième plateforme réalisant exclusivement des expériences dans des conditions contrôlées et participant au projet ANR Investissement pour le futur «PHENOME-EMPHASIS» (réseau de plateformes de phénotypage français) piloté par F. Tardieu et J. Legouis (2012-2020). La participation de la 4PMI concerne le phénotypage des racines et les innovations associées financées par Phenome.

Dans le cadre du projet européen “ABSTRESS” (Améliorer la résistance des cultures légumières aux STRESS abotiques et biotiques combinés, 2012-2017, coord. A. Charlton, FERA, Royaume-Uni), C. Salon était le coordinateur du Workpackage "Conception d'un dispositif expérimental et phénotypage ". La 4PMI a développé et utilisé des protocoles pour la caractérisation écophysiologique des réponses du pois et de Medicago au stress hydrique et à la fusariose. Des communications orales au niveau européen ont mises en valeur la plateforme et une publication est en cours avec des partenaires britanniques.

Dans le projet européen «LEGATO» (Légumineuses pour l'agriculture de demain, 2013-2018, coord. R. Thompson), C. Salon a été impliqué dans l'ensemble du projet et coordonne le WP3 «Optimisation de l'adaptation des plantes aux stress abiotiques». La 4PMI collabore en particulier avec Ralf Metzner et Carol Windt (Plant Sciences (IBG-2), Forschungszentrum Jülich, Allemagne) pour la caractérisation phénotypique du pois soumis à un stress hydrique et thermique par différentes méthodes (RhizoTubes®, imagerie par résonance magnétique et tomographie par émission de positrons). En outre, une école de recherche commune pour les projets européens Legato et Eurolegumes a permis de former une trentaine de jeunes chercheurs et sélectionneurs de plusieurs pays au phénotypage.

Seules les plates-formes de Montpellier (PhénoArch) et de Dijon (4PMI) fonctionnant dans des conditions environnementales contrôlées ont été associées au projet européen «EPPN» (Réseau européen sur la phytogénicité des plantes, 2012-2016, coord. U. Schurr, Plant Sciences (IBG-2), Forschungszentrum Jülich, Allemagne). Dans le WP4 "Bonnes pratiques de phénotypage" coordonné par F. Tardieu, la 4PMI a comparé ses résultats concernant le phénotypage du colza à ceux obtenus par les autres plateformes du consortium dans des conditions contrôlées. Au sein de l'EPPN, la 4PMI a accueilli un partenaire israélien (Josh Klein, Centre Aaro Volcani) pour une série d’expériences ("Accès transnational") sur le stress hydrique chez le blé.

C. Salon coordonne le projet ANR MIRGA (2016-2019) avec les partenaires UMR BP & MP Montpellier et une société privée Biogemma (Clermont Ferrand, France). MIRGA se concentre sur la recherche des gènes impliqués dans le développement des racines du maïs, l’adaptation des plantes au stress hydrique, la robustesse des traits phénotypiques et leur corrélation entre les méthodes (par exemple, les conditions contrôlées et sur le terrain) en fonction de la phénologie des plantes. Les études GWAS comprennent la caractérisation de l'architecture des racines de 400 génotypes de maïs et la validité des gènes clés pour la résistance à la sécheresse sera validée fonctionnellement. Afin d'élargir le champ d'application aux dicotylédones, les mutations dans les orthologues d'Arabidopsis de gènes de maïs candidats seront examinées dans des situations normales et sous stress hydrique.

La 4PMI participe également à trois projets européens Horizon 2020 récemment lancés:

• pour EUCLEG (coord. B. Jullier, Unité de recherche pluridisciplinaire des Prairies et des Plantes Fourragères, Lusignan, 2017-2021) la 4PMI mènera une expérience combinant le stress abiotique (sécheresse) et biotique (fusarium) sur Medicago avec IPS2 (F Frugier);
• pour SOLACE (coord. P. Hinsinger, UMR Eco & Sols Montpellier, 2017-2021), la 4PMI contribuera, en collaboration avec H Fréville (AGAP UMR, Montpellier) et X. Draye (Université catholique de Louvain, Belgique) au phénotypage d'un panel de blés;
• la 4PMI participe également au projet EPPN2020 qui représente la continuité de l’EPPN (par exemple, de bonnes pratiques de phénotypage, des procédures de calibration communes, ...). Pour ce projet la 4PMI offrira 3 accès transnationaux.